Les trois principes fondateurs de la gouvernance mutuelle sont le système électif, la collégialité et la réassurance. Au niveau électif, les administrateurs – qui sont tous des assurés de la mutuelle - constituent l’ensemble des conseils d’administration des entités du Groupe mutualiste. les élus sont des relais d’information descendante et ascendante entre les sociétaires et l’entreprise. La collégialité, consubstantielle du mutualisme se traduit par une réflexion collective en amont avant de parvenir à toute décision d’importance. La réassurance du Groupe permet à chaque échelon -local, régional, national, d’acheter une protection financière à l’échelon supérieur.
Les structures nationales du Groupe, dont les rôles sont clairement séparés et identifiés, s'articulent autour de :
Elle constitue le pôle institutionnel : elle représente les sociétaires et, à ce titre, elle est chargée de la définition et du contrôle des grandes orientations du Groupe. Elle exerce le rôle d'Organisation professionnelle agricole et veille à la valorisation et à la promotion des principes d'action mutualistes.
Groupama SA porte les activités opérationnelles: c'est une société anonyme, qui a la responsabilité du pilotage des activités opérationnelles du Groupe, de la réassurance des Caisses régionales, en vertu d'une convention de réassurance, ainsi que de la réassurance et du développement des filiales.
Par ailleurs, Groupama Holding est une société financière détenue à 100 % par les Caisses régionales et qui exerce pour leur compte le contrôle financier de Groupama S.A. et de ses filiales.